Гены рождаются и умирают. И воскресают.

Очень часто встречаю мнение, что все мутации для особи смертельны. Мутанты – синоним уродов, мутировавший ген – обязательно что-то вредоносное, а понятие "полезные мутации" воспринимается с большими оговорками. На самом деле большинство мутаций нейтральные. Ген, как и все в этом мире, переживает рождение и смерть. Если мутация действительно несовместима с жизнью особи – ген исчезает навсегда. Но это происходит не так часто. Бывает, что мутация в гене никак не влияет на успешность дальнейшего размножения. Тогда в нем накапливается такое количество мутаций, что рано или поздно ген выключается, но остается погребенным в геноме. Ген умер – родился псевдоген.

Анализ человеческого генома вскрыл большое кладбище псевдогенов, которые когда-то служили нашим предкам верой и правдой. Например, по мере развития зрения, уменьшалось количество обонятельных рецепторов. И сейчас в человеческом геноме из около 1000 генов, кодирующих обонятельные рецепторы,
600 являются псевдогенами, а работают только 400. То есть наш геном носит в себе потенциально
600 обонятельных рецепторов, а мы о них и не догадываемся.

Псевдогены интенсивно изучаются, составляются базы даных с целью изучить когда и по какой причине эти гены выключились. Вообще в геноме около 12 тысяч
молчащих генов.

Иногда случается, что "умершие" гены восстают из мертвых. Так случилось с геном Immunity-related GTPase (
IRG), который играет важную роль в защите от внутриклеточных патогенов.
Анализ этого гена у обезьян показал, что этот ген был "выключен" ретротранспозоном Alu около 50ти миллионов лет назад, а 20 миллионов лет назад восстановился другим элементом ERV9.

Коль скоро гены могут сами восставать из мертвых, то уж точно их
можно и разбудить. В этом смысле становятся интересными "спящие" гены устойчивости против болезней. Обнаружилось, что человечество понесло утрату в виде гена дефензина, котрый стал псевдогеном 7 миллионов лет назад в результате мутации. Восстановление гена у лабораторных условиях показало, что ген может сильно пригодится в борьбе с ВИЧ.

UPD: бонус об эволюционных фокусах и
причудах полового отбора у стебельчатоглазых мух от
nature_wonder .

UPD1: еще один жирный бонус о том,
как целые вирусы восстанавливают, которые существовали 4 млн лет тому назад. от
shvarz 

Advertisements

Очень полезные ссылки.

Короткая, но емкая серия постов на тему

Доктор, поднимите мне

веки
иммунитет!


Часть 1

Часть 2

От
tanchik

Иммунитет – это не то, что падает и посему нуждается в периодическом подъеме. Ну как предмет с пола. А иммуностимуляторы, которые реально работают – не безвредная штука без побочных эффектов и опасностей.

Иммунная система представляет собой активный баланс двух разнонаправленных сил.
Есть ПРОвоспалительные силы, задача которых – вызвать воспаление, разрушить микроб/вирус/опухолевую клетку, пусть даже путем повреждения тканей вокруг, но на войне как на войне…То есть говоря кратко (а подробно, если интересно, почитайте сами), в месте воспаления творится настоящая война. Мясорубка. Ошметки клеток, куски микробов, и многообразные химические сигналы, стимулирующие продолжение, усиление, вызывающие другие клетки на подмогу. И это, если б не существовало второй силы, продолжалось бы до тех пор, пока организм не разрушил бы сам себя.

Вторая сила – АНТИвоспалительная. Включает в себя кучу белков, передающих сигналы остановиться, а также специализированные клетки, в основном регуляторные Т-лимфоциты (Треги). Также к этой системе можно отнести кучу защитных механизмов. Например, вызывающих самоубийство у активированной клетки иммунной системы, если она не получила от другой клетки (чаще всего антиген-презентирующей) обратный сигнал. Это срабатывает так: на место воспаления пришло "подкрепление", но микробы уже все убиты и куча клеток занята лишь уборкой последствий и починкой разрушений. Тогда клетки подкрепления, уже получив активацию (их же звали) не получают второго сигнала, разрешающего. И самоубиваются.

Иммунитет у взрослого НИКОГДА не "падает" сам, без конкретной на то причины. И причина эта в 99% случаев будет НЕ в иммунной системе. Если же она окажется реальным дефектом иммунитета, то лечить вы это будете очень серьезными препаратами, только у врача.

И еще важный
пост о БАДах от
uncle_doc. В общем-то ничего нового, но вот я распечатала и дала почитать родителям. По факту могу сказать, что обязательно распечатайте и покажите бабушкам, дедушкам и другим потенциальным жертвам лохотронов. Должно подействовать.

Мозг и время.

Давненько что-то я
про мозг не писала. Тут как раз
статья симпатичная подоспела. Кто читает на английском – лучше идти и читать оригинал. Кому лень читать, я сейчас напою. Но сразу скажу, что оригинальная статья из серии «мороз по коже», лучше читайте оригинал. И вообще, кто еще не подписан на
The Edge, то я не понимаю почему.

Мозг сам по себе пребывает в темноте и тишине черепной коробки. Он только контактирует с внешним миром посредством электрических сигналов, поступающих по скоростных путях нервных волокон. Поскольку различные типы сенсорной информации (слух, зрение, прикосновение) поступают с различной скоростью различными путями, мозг должен решить архиважную задачу: какая самая лучшая история об окружающем мире может быть
сконструирована?

Вопросом «как мозг обрататывает и анализирует время» задавались давно. Мы все наблюдаем, что в детстве время идет как бы медленее, а потом ускоряется – только что отпраздновал однин день рождения, как пора опять покупать свечи на торт. Пришли к выводу, что время восприятия зависит от количества и интенсивности новых или необычных событий. В детстве большинство событий новые – поэтому и время ощущается «медленнее». Впрочем, к этому выводу можно прийти и без сложных экспериментов. Это в глобальном масштабе.

В локальном тоже наблюдают интересный эффект – если перед испытуемым прокручивать однообразные картинки с одинаковым темпом, и вдруг показать странное изображение в том же темпе, то испытуемый субъективно считает, что время показа странной картинки дольше, чем однообразных. Время как бы замедляется.

Допустим, замедляется зрительная картинка. А слуховая? Будет ли в этот момент восприятие звуков замедлено тоже так, как бы затянули проигрывание магнитофонной записи?

Провели эксперимент. Сообразили прибор, который устроен по принципу детской игрушки, где на двух сторонах диска нарисованы разные изображения. На одной стороне – ветка, на другой – птица. Если диск вращать, то в какой-то момент мозг сопоставляет изображения и видит птицу на ветке. А если вращать слишком быстро, то изображения смазывается и мозг вообще ничего не видит. Установили частоту смены изображений так, что «смазывание» только-только началось. Нацепили на испытуемого прибор с мелькающими картинками и бросили в пропасть. Ну не в пропасть, и не бросили, сам прыгнул. В общем устроили ему свободное падение – как бы эрзац необычного нового переживания с субъективным «замедлением» времени. Если мозг в момент новых переживаний в общем «замедляет» время, то и порог «смазанной» картинки изменится и испытуемый начнет ее видеть. Действительно, испытуемый свободное падение оценивал по времени как довольно длительное. Но вот «смазанная» картинка так смазанной и осталась. Получается, что разные переживания по разному обрабатываются.

Или вот еще эксперимент. Испытуемый нажимает на кнопку и видит вспышку. Одновременно. Но вспышка это как бы следствие нажатия. Делаем между нажатием и вспышкой интервал, скажем в две сотых милисеккунды. Мозг окончательно фиксирует, что вспышка наступает после нажатия. А теперь опять убираем интервал. И знаете что? Мозг думает, что вспышка появлятеся ДО нажатия, хотя на самом деле это не так.

В результате этих всех экспериментов нейробиологи пришли к парадоксальному выводу, что
мозг как бы ждет самый дальний и медленный сигнал, чтобы уже собрав все сигналы и максимум информации об окружающием мире, синхронизировать их в одно временное событие. Это имеет также эволюционное значение. Что было бы, если бы мозг человека, получая зрительную информацию о наблюдаемом тигре, который крадется в зарослях с контрастным солнечным освещением, с разной скоростью воспринимал и анализировал темные и светлые его полосы? Тигры бы распался на пространственно-временные картинки, подобрался бы к человеку и съел его.

Хотя статья начинается с истории о монгольской империи Кублай Хана, я этим закончу. Когда империя Кублай Хана (1215–94) разрослась до огромных размеров, стало сложно ею управлять. И он придумал разсылать гонцов в самые отдаленные уголки империи, чтобы они собирали там информацию и возвращались с новостями. Возвращались они с разной скоростью, в зависимости от погодных условий, конфликтов или собственной расторопности. Но у самого Кублай Хана была задача такая же, как у нашего мозга – собрав максимально информации, установить, в какой последовательности какие события происходят в империи.

sub ratione Unius

В нашу общину Церкви Сути Живого Зеленого
1 с братским визитом прибыли адепты Церкви Поиска Сути Вечного
2. Говорят, что обзавелись могущественным артефактом. Видит Суть вещей на расстоянии
3. И суть живого зеленого в том числе. Артефакт есть тайное
nomen trigrammaton (трехбуквенное имя) NMR
4 – призвано служить обозначением Отсутствия Необходимости
(No
More
Röntgen). А означает то, что божественная сущность провидческих лучей
5 должна быть замещена приложением отталкивающе-притягивающей божественной силы
6, что ведет короткоживущему порядку тонкой материи
7 с последующим восстановлением исходного состояния
8, сообщающего пресвитеру
9 ту самую Суть, которую мы, слепцы, ищем. За Обозначение Сущности артефакта
10, обладающего такими замечательным качествами, двух адептов Церкви Поиска Сути Вечного канонизировали
11. А может быть даже и троих.

Мысленно вознося молитвы Нозерну, Саузерну и святому Вестерну
12, окунулись мы в изучение
артефакта.

Итак, элементам тонкой материи
13присуще вращательное совершенство божественной Сущности
14, которое чудесным образом не связано с перемещением частицы как Отдельного, Но Целого. И хоть оно не связано с реальным Вращением, тем не менее порождает внутреннюю отталкивающе-притягивающую божественную силу
15, которая взаимодействует с внешней
16 подобной силой.

Чудесный глаз артефакта распознает только те элементы тонкой материи, вращательное совершенство
14 которых отлично от Абсолютного Ничто
17. Связь силы вращательного совершенства
18 и внутренней отталкивающе-притягивающей божественной силы
15определятеся Заклятием Мю
19. При приложении внешней отталкивающе-притягивающей божественной силы (
ab alio) состояния вращательных совершенств переходят в упорядоченное состояния на новый энергетический уровень, из которого можно его можно полностью возвратить к своей Собственной Сущности с испусканием волнующей Божественной энергии
20 и к которому они привязаны, помимо которого они суть ничто. Всепроникающий глаз артефакта принимает Момент Возвращения
21, как отец принимает возвращение блудного сына. Скорость возвращения зависит от окружения тонкой материи, их энергетики и, вероятно, расположения звезд и настроения пресвитера
22, сказали нам адепты.

Приняв волновой Акт Момента Возвращения, глаз артефакта фиксирует Сущность (
essential) в виде регистра Актов
23, расшифровкой и интерпретаций которых и занимаются прибывшие к нам адепты. Некоторые так поднаторели в расшифровке, что способны воссоздавать Прообраз и Подобие Сущности
24.

Мы, адепты Церкви Сути Живого Зеленого
1, с большим оживлением слушали суть этой медитативной практики
25. Предложили тут же взглянуть в суть Живого Зеленого
26. Подобно св. Фоме, увидели в откровении артефакта свидетельство о единственном бытии, в котором Сущность Сути Вечного
2 не отличается от Сути Живого Зеленого
27.

Решили, что будем кооперироваться в целях поиска Вечной Истины и запишем в скрижалях это Откровение
28.

________________________________________
___________________________________

1. Отдел молекулярной биологии растений

2. Отдел экспериментальной физики

3. Неинвазивные методы исследования трехмерной структуры живых объектов

4. Nuclear Magnetic Resonance

5. Электромагнитное излучение с длинами волн 10-4 – 10 А (10-5 — 1 нм)

6. Магнетизма

7. Резонансной настройки ядерных моментов

8. Релаксации

9. Пост-доку

10. Разработку принципов ядерного магнитного резонанса

11. Представили к Нобелевской премии

12. Основные молекулярные методы анализа нуклеиновых кислот и белков.

13. Элементарным частицам

14. Собственный момент импульса элементарных частиц

15. Магнитный момент

16. Магнитное поле

17. Нуль, просто нуль

18. Угловой момент импульса вращения

19. μ=γJ

20. Релаксация ядерных моментов с испусканием электромагнитный волн радиочастотного диапазона

21. Поглощение энергии фиксируется радиочастотным мостом и затем записывается самописцем

22. О, да. Шумы – реальная проблема NMR -спектроскопии

23. Спектры NMR, где зафиксированы сигналы ядер атомов, входящих в определенные функциональные группы,а также интегральная площадь, ограниченная пиком, которая строго пропорциональна количеству резонирующих атомов, а ядра, лежащие через 1-4 связи, способны давать мультиплетные сигналы в результате расщепления друг на друге

24. Трёхмерное моделирование структур, визуализированных посредством NMR

25. Потеряли нить повествования где-то на заклятии релаксации Mz(t)=Mz,eq(1-2e –t/T1)

26. Посмотрели градиент распределения воды в интакнтых стеблях и семени гороха при большом разрешении в NMR с мощьностью в 5 тесла.

27. Виртуальные срезы стебля при использовании NMR –спектроскопии воспроизводят анатомическую структуру, наблюдаемую при использовании цитологических срезов. Метод позволяет также неинвазивно визуализировать количественные градиенты некторых метаболитов, таких как сахароза и пару аминокислот.

28. Наконец-то вчера дописали и submitted статью

Про PloS

Чтобы ученому, биологу, например, опубликовать хорошую статью, надо не только придумать идею, плодотворно поработать в лаборатории, а потом мучительно накропать результаты и обсуждение. Надо еще и заплатить издательству за то, чтобы приняли статью. Каждая красивая цветная картинка весит дополнительно и статья в пристойном журнале с красочными иллюстрациями может потянуть на не одну тысячу долларов. Платят обычно из бюджета проекта.

Когда редактор журнала получает первую версию статьи – он рассылает ее анонимным рецензентам, которые придирчиво изучают статью и письменно пишут свое мнение. Рецензию они пишут задаром – это престижно и просто приятно: читаешь чужую статью и видишь ляпы. Думаешь, вот какой я умный.

Если статья получила положительные отклики рецензентов, она публикуется, а автор получает парочку авторских репринтов. Другие ученые, если хотят почитать научный шедевр – должны заплатить за подписку. Чем круче журнал – тем дороже подписка. Более того, с момента публикации автор статьи теряет на нее авторские права и даже не может выложить электронную копию статьи у себя в блоге. Таким образом, издательство научных журналов паразитирует на тщеславии и любопытстве ученых.

В конце-концов ученым это порядком надоело и они решили наказать жадные издательства. Они сообразили он-лайн журналы
PloS One,
PloS biology,
PloS genetics,
PloS medicine и другие, где и публикуются себе за fair price и которые открыты всем желающим почитать. А чтобы окончательно утереть нос Science и Nature, они устроили статьям жесткий отбор. И теперь получается что ни статья, то шедевр. Можно просто читать все подряд и только охать от удивления.

Ну что мы знаем об особенностях совокупления водомерок и как эволюционно развивались гентиалии водомерок для совокупления на такой неустойчивой среде?

Или вот,
гендерные различия в поведении мужчин и женщин, когда им подсовывают для рассматривания лица некондиционных бебиков (в поражениями кожи, с синдромом Дауна). Оказалось, что женщины воротят нос от неправильных беби интенсивнее, чем это делают мужики. Нервы слабые, что ли?

Или например,
проинспектировали производство лекарств в Индии.

Или
полезен ли спорт при климаксе. И если да, то какой?

Короче, читать не перечитать. Я оторваться не могу.

Но и это еще не все. Все-таки за окном эра копьютерных технологий. Изюминки транслируются в
PloS blog,
PloS twitter,
PloS facebook ,

PloS odnolkassniki ru
. И я буду время от времени обозревать интересные статьи из PloS. Получится PloS LJ

Вопрос.

Друзья,

только за последние сутки вас прибыло около 80ти. Я свои ходы записываю – ничего такого горячительного я последние пару дней не писала, факт. Откуда резонанс? Кому не лень, черкните в коменты, откуда вас направили сюда? Мне просто любопытно. А я вам пообещаю что-то интересное впредь написать. Коменты прикрою для скромных.

Заранее благодарю.

UPD: Большинство пришло с habrahabr.ru Впервые о нем слышу, но теперь буду знать. Спасибо,
незнакомый, но любознательный друг.