Получила результаты экспрессионного анализа, секвенирование РНК по методу 454. 48 проб. На выходе увесистый ZIP, в распакованом виде около 300 гигов (но я все еще не распаковала), а это уже около 2000 (2 тыщ) штук разнообразных файлов, преимущественно Excel, которые при открытии весело сообщают, что ячейки в таблице закончились.
readmy доброжелательно гласит:
The probability of gene A expressed equally between two samples can be calculated with the following formula:
2x(1-
∑p(i|x))
(if
∑p(i|x)>0.5)
p(i|x)=(N
2/N
1)
y*(x+y)!/x!y!(1+N
2/N
1)
(x+y+1)
НЕРВНО РЖУ. Даже если открывать файлы, чтобы посмотреть, что там в них внутри, не вникая в содержание, то по минуте на каждый файл – это чистых 4 дня рабочего времени. И это только глянуть мельком! Мне кажется, биоинформатика уже укусила себя за хвост.
Пысы. А у нового Excel есть ограничение по количеству ячеек в таблицах? И о чем эта формула вообще? УМОРА! Я вот даже еще совершенно не огорчилась, я просто ошарашена. Моя задача – это все ПЕРЕСЧИТАТЬ! Пойду лучше горох подготовлю на высадку.
progenes 