Футуризм

С ГМО в Германии мы помним, что не фонтан. Опять таки, дележ грантов вышел на новые горизонты. Заявку на изучение парочки генов можно писать, но этим можно только развеселить фонды. По крупному загрести можно крупными прожектами. Геномику и транскиптомику уже освоили, секвенированием геномов никого не удивишь, метаболомику подгребли, надо что-то новое. Новый челендж –

феномика.
В комбинации с другими -омиками.

На деле это неинвазивное фиксирование всевозможных параметров растений, у которых разные генетические бэкграунды. Ну что можно зафиксировать? Скорость роста, размер растения в процессе роста, площадь листа, прирост биомассы, цвет, архитекруру, эффективность фотосинтеза, отмирание, заражение болезнями и развитие этих болезней, измерение химического состава семян (да-да, неинвазивное), состояние почвы и пр. Для этого дела придумывают huge теплицы с huge растений, которые фотографируются в постоянном режиме и биоинформатики теперь уже не гены сортируют,
а обрабатывают huge картинок. Короче, биоинформатики, внимание, сейчас imaging – новый тренд.

Ощутимого выхлопа от этого всего дела еще нет. Все, что я наблюдаю, это окольные пути, чтоб в результате этих huge усилий добраться до какого-то гена (одного) и его поанализировать традиционными методами. Но кто ищет простые пути?

Пока еще есть huge проблемы технического плана – листья перекрываются, заросли мха на земле флюоресцируют своим хлорофиллом и дают huge помехи, транспортировка растений – стресс и вообще, теплица, даже если она huge это слишком стандартно. Поэтому придумывают самоходные камеры, которые ездят по полям. Но опять таки, колеса по земле – это воздействите на корни и тоже стресс. В общем, делюсь я как-то своим скептицизмом с коллегой по поводу этих huge проектов, а он мне и говорит: Да, разумеется это все ерунда! Вот если бы такой летающий вертолет с камерой, это дааа.

Я открыла рот от удивления. Но потом подумала, что может в результате таких вот диких фантазий и рождается в будущем что-то действительно новое и интересное.

Это меня спросили в личке о проекте
биохакерской группировки BioCurious
Glowing Plants.

Я вам честно скажу, идея встроить флюоресцентные белки в растения и украсить ими себе жизнь появилась ровно тогда, когда такие белки вообще открыли.
Обратите внимание на год. Уже и Нобелевскую премию дали, уже в каждой растительной лаборатории есть светящийся табак. Но до сих пор у нас нет ландшафтов как в фильме Аватар. Проблема в том, что для того, чтоб что-то купить, надо что-то продать. Чтоб GFP завсетился, его самого перед этим возбудить другой волной. Все красивые флюоресцентные картинки сделаны в ультрафиолете. Есть такие белки, которые и автофлюоресцируют, вроде люциферазы, но им тоже энергия надо.

Если я не ошибаюсь, один из последних удачных экспериментов по получению автофлюоресцирующих растений табака,
был опубликован в 2010 году. Для ориентирования пару фактов – при полной темноте и при большом воображении можно видеть слабое и быстро угасающее зеленоватое свечение табака еще примерно 20 минут после того, как выключили свет. К слову, коллеги пробовали под это дело
фирму организовать еще в 2010 году. Что-то мне подсказывает, что не все получилось, поскольку kickstarter кивает на кооперцию с Krichevsky. Это все, други мои, о передовом крае биотехнологии светящихся растений.

То есть до аллей светящихся растений еще очень-очень-очень далеко. Но! Возможно у них что-то действительно получится со светящимися растениями. В будущем. И что совершенно точно у них уже получилось, так это привлечь внимание широких слоев населения к биотехнологии и повыступать против идеи патентования генов.

Advertisements

Про Ули Штека

Что-то сегодня под руку швейцарцы подворачиваются. Я плохо помню имена. Из всех известных альпинистов я знаю только Ули Штека, потому что мне его
когда-то показал
neuraum и этот альпинист поразил меня до глубины души. Он из тех альпинистов, которые могут прервать маршрут,
чтобы спасти замерзающего коллегу.

К сожалению, линк на ютубе дохлый, но
я нашла в другом месте. Под впечатлением я даже стала бегать под саудтрек к фильму Radical Face, "Welcome Home". Вдохновляет, знаете ли.

А
сейчас пишут, что во время восхождения на Эверест, их группа была избита шерпами и восхождение пришлось прервать. В составе группы, кроме Штека, итальянский скалолаз
Симоне Моро и британец Jonathan Griffith.

Штек говорит, что есть серьезный конфликт между непальцами и западными альпинистами, особенно в том месте, где альпинисты поднимаются без сопровождения шерпов. Такие дела. Жалко.

Плоды просвещения

Даю интересную ссылку об эволюции взглядов еще одного анти-ГМО блогера.

How to temper an anti-GMO blogger: My story

Я тоже открываю для себя новые аспекты анти-ГМО движения. Узнала, почему тру-органик против ГМО и
не только.

Наткнулась случайно на
подробный каталог всех существующих методов гибридизации и селекции растений. Характерно, что каталог создан
организацией, продвигающей органик агроиндустрию. И все эти методы посортированы: манипуляции на уровне организма – ок, манипуляции на клеточном уровне – куда ни шло, манипуляции на субклеточном уровне – категорически против.  В основе лежит принцип – сохранение целостности.

Читаю. Химический мутагенез, полиплоидизация – ок, допускается. Это манипуляция на уровне организма. Физическая кастрация это тоже не нарушение целостности. А слияние протопластов – это уже нарушение целостности.Странно. Тут я подумала, ну что за ерунда? А оказалось

В 1992 году в Швейцарии был принят занимательный
конституционный закон, с формулировкой "die Würde der Kreatur" (достоинство живого существа). Причем происхождение живого существа явно носит признаки творения. Но и это еще не все. Согласно заключению швейцарской комиссии по биоэтике, формулировка "
достоинство живого существа" простирается и на растения, что было высоко оценено комиссией по выдаче шнобелевских премий в
2008 году. Интересно, что во французской версии закона "die Würde der Kreatur" переведены как "intégrité des organismes vivants", что комиссия по биоэтике сочла неправильным. Гулять, так гулять.

Швейцарская комиссия по биоэтике подошла к вопросу серьезно
и нарисовала алгоритм, с помощью которого пробовала разобраться, есть ли у растения собственные интересы и ощущения, а стало быть и достоинства. Если у растения есть ощущения, значит есть и достоинство, то нарушать его прикосновенность неэтично. А есть ли у растений ощущения, мы не знаем. По мнению комиссии – незнание является морально релевантым, поэтому по умолчанию – нарушать прикосновенность растений нельзя, пока вопрос об ощущениях не прояснится окончательно. Короче, теперь это такой закон в Швейцарии. Кстати, бактерии вынесены из списка достойных, грибы остались тоже неприкаянными. Есть мнение, что это потому, что в Бытие, глава 1, ни те, ни другие не упоминаются.

В Нейчур по этому поводу пишут:

All plant biotechnology grant applications must now include a paragraph explaining the extent to which plant dignity is considered. “
But scientists don”t know what it means,” says Beat Keller of the Institute of Plant Biology at the University of Zurich who is running the first field trial — of disease-resistant corn (maize) — to be approved under the new legislation.

Но шерифов не волнуют проблемы индейцев. В законе есть некоторые послабления. Нарушать прикосновенность и целостность можно, если
очень надо , а именно во имя здоровья человека и животных, для обеспечения продовольствия и для умножения знаний. Для ученых отвели заповедник, огородили его колючей проволокой и разрешили
немножно нарушать целостность и достоинства креатур. Впрочем, дебаты на эту тему продолжаются.

В Германии, записывайте для протокола, в этом году вообще
ни одно полевое испытание трансгенных растений
не проводится. Вернемся еще раз к целостности креатур. Швейцарское законодательство вдохнуло новую идеологию в экологическое движение. Из
доклада представителя той организации, которая продвигает экологически-верные методы селекции: "I am working with the plants, not on the plants. I apply selective pressure, and the plants decide where to go." Now, that’s elegant breeding!

Ну вы поняли, растения решают, куда им идти. Что лично мне бросилось в глаза в этом же докладе. Первая треть доклада – это подсчет доходов Монсанты и прочих монстров. И сразу после этого – "а мы предлагаем уважение к достоинству растения" и
Der Bio-Landbau beansprucht für sich, „naturnäher“ oder „natürlicher“ zu sein (Органическое сельское хозяйство утверждает, что "ближе к природе" или "естественнее"). Вот так, кастрация растения – это близко к природе и естественно, а перенос гена – это нарушение целостности. Юристам на заметку –
права растений.

Лабораторные байки

Я тут гены на биочипах смотрю, какие включились, а какие выключились. Раньше образцы на фирму отправляли, но с некоторые пор у нас завелись приборы хитромудрые, так что сами химичим. Должна сказать, что в последнее время технология рванула, хоть и требует прилежания и аккуратности, но все такое стандартизированное, нано-пренано. Сливаю по микролитрам, что-то там в махоньких пробирочках инкубирую и наношу в микродозах на микростекла в стерильных безпылевых безозоновых лабораторих.

А сверху накрываю

стеклом,на котором примерно 2 на 4 см нанесено 500 тыщ нано-гено-точек. Вот таким

Это вступление, чтоб представить, какое оно все ми-ми-мишное.

Но что характерно, что в процессе протокола такого всего точного, хрупкого, отточеного и аккуратного, встречаются чудовищные баги. Например, после нанесении проб на стекла и упаковки чипа в такой металлический контейнер (это все не дыша, не дотрагиваясь до краев и не дрожащей рукой, быстро и точно),

этот контейнер надо взять крепко в руку и
изо всех сил шарахнуть (именно, что шарахнуть) им об твердую поверхность, чтобы воздушные пузыри, которые там образовались, оторвались от края и стали свободно плавать. По столу стучать нельзя, там сканер. Поэтому для этого дела используется центрифуга, которая стоит под столом. Хотели уже убрать центрифугу, но оказалось, что нет более подходящего места для избиения контейнеров.

Или, например, современные приборы для анализа нуклеиновых кислот, вроде биоаналайзера. Там пробы

заливаются в такой вот чип

.

Согласно инструкции от производителя, все просто



На самом же деле, чип надо подготовить и залить туда 9 микролитров геля под давлением из шприца. Это искусство. Я каждый раз, когда заливаю, не перестаю удивляться. Надо шприцом создать давление (плавно, но сильно). Зафиксировать поршень на 30 секунд (быстро), потом отпустить фиксаж (очень быстро), но поршень держать пальцем еще ровно 5 секунд (зачем-то). Потом отпустить поршень (нежно), который под давлением будет возвращаться в исходное положение (медленно). Но в исходную точку он сам возвратиться не может (почему-то) и последние 8 миллиметров ему надо помочь (медленно, но не очень). Так в протоколе.

Последний звонок

Кому интересно – короткий репортаж празднования последнего звонка в немецкой гимназии, которую заканчивает мой лоботряс.

http://l.lj-toys.com/?auth_token=sessionless%3A1491292800%3Aembedcontent%3A13257115%2618%26%260%26youtube%26ASOhwSuSF9g%3A2179549cbd373ce50318e17b84e938ec78ce0541&source=youtube&vid=ASOhwSuSF9g&moduleid=18&preview=0&journalid=13257115&noads=

Об активистах анти-ГМО движения, плагиате и глутамате.

Скандальчик. Есть такая
Suman Sahai. Кстати, пока я собиралась писать о ней, статью на википедии проапдейтили буквально на днях.

Так вот, эта Суман Сахаи создала индийскую анти-ГМО организацию, известна и
отечественным борцам, а в последнее время активно мелькала и в
немецком телевизоре, объясняя, какое же зло это ваше ГМО. При этом представлялась как известный эксперт, профессор Хайдельбергского университета, где и хабилитировалась по теме "Глутамат в мозгу млекопитающих". К тому же, лауреат премии Борлоуга.

Зануды (анонимные, кстати) порылись в диссертации и обнаружили, что страниц примерно 12 содраны из чужой статьи один в один, которая не процитирована надлежащим образом. Редакция журнала
Laborjournal обратилась к автору статьи и узнала, что он не знает, кто такая Сахаи и факт списывания его работы был для него тоже неожиданностью.

После чего журнал обратился в Хайдельбергский университет, который до этого момента хранил подозрительное молчание.
Официальный ответ появился уже после выхода статьи. В пресс-релизе говорится, что эти нюансы известны уже пару лет и фрау Суман Сахаи профессором университета не является и плагиат действительно имеет место быть.

В общем, и не профессор, и плагиатчица. Что там с премией Борлоуга? Борлоуг действительно учредил престижную
Всемирную продовольственную премию. Но, как мы видим, среди лауреатов Сахаи не числится. Потому что ей вручили
другую премию с тем же громким именем, но учрежденную индийской фирмой по производству удобрения. Декоративная такая премия местного значения, мимикрирующая под солидную.

Такой вот Болливуд.

Сентиментальное

По делу будет в следующем посте, а сюда можно приносить мне носовички, утирать слезы умиления.

Не буду оригинальной – время летит быстро. Еще совсем недавно провожали малыша в школу, а сегодня уже первый выпускной экзамен. Прошлая неделя была сумасшедшей. Немецкие выпускники знают толк в развлечениях. Каждый день проходил под каким-то карнавальным девизом. Утром за завтраком торжественно объявлялся этот девиз и вся семья, толкаясь и причитая, бегала по дому, разыскивая подходящие артефакты. Я громко ворчала, как древняя старуха, что взрослые люди, особенно выпускники, должны соображать заранее, а не устраивать в последнюю секунду челендж для домочадцев. Но на другой день все повторялось, но с новыми вводными.

Понедельник – опять в первый класс. Недоросли натягивают гольфы, короткие штанишки, достают старые ранцы с коняшками и плюшевых медведей и в таком виде идут в школу.

Вторник – старомодный хиппи. В ход пошли все мои браслеты, которые стали на день фенечками, пацифик рисовался мелом на спине, из проволоки скручены очки а-ля то ли леннон, то ли поттер. Венчал это чучело огромный дрим-кетчер с перьями.

Среда – смена пола. Ноу комментс. Да, груди тоже были. И парик.

Чертверг – новомодный нерд. Подтяжки и бабочка. А вид и так глуповат.

Пятница – последний день в школе, выпускники окончательно сходят с рельсов и весь город стоит на ушах. Ходят шумной пестрой толпой с пищалками, мегафонами по городу. Младшеклассники, которые не успели спрятаться, густо обливаются краской и разрисовываются помадой.

Я к чему клоню. Когда я заканчивала школу, то своих родителей уже считала пожилыми людьми. Сын велел срочно зарисовать седину в голове и обещал какое-то время еще считать меня молодухой. 41. Вот, теперь можно утешать.